مراجع تقلید در بیانیه‌های جداگانه از رهبر معظم انقلاب پشتیبانی و حمایت کردند و به یاوه‌گویی‌های ترامپ پاسخ تند و تیز دادند.    
آیت‌الله‌ سیستانی در بیانیه شدیداللحنی تجاوز نظامی به کشور و هرگونه تهدید علیه رهبر معظم انقلاب اسلامی ایران را محکوم کرد.
به گزارش خبرگزاری حوزه، متن این بیانیه به شرح زیر است:
بسم الله الرحمن الرحیم
مرجعیت عالی دینی در نجف اشرف بار دیگر ادامه تجاوز نظامی به جمهوری اسلامی ایران و هر گونه تهدید سوءقصد به رهبری عالی دینی و سیاسی این کشور را به شدت محکوم می‌کند، و قاطعانه هشدار می‌دهد که هر اقدام مجرمانه‌ای از این‌گونه – افزون بر زیرپاگذاشتن آشکار موازین دینی و اخلاقی و نقض صریح عرف و قوانین بین‌المللی – پیامدهای بسیار وخیمی برای سراسر منطقه در بر خواهد داشت و چه بسا منجر به خروج کامل اوضاع از کنترل و بروز هرج و مرج گسترده‌ای شود، که رنج ملت‌های منطقه را افزایش داده و منافع همگان را به شدت به خطر بیندازد.
از این رو ما قویا از همه نهادهای تأثیرگذار بین‌المللی و دولت‌های جهان به ویژه دولت‌های اسلامی می‌خواهیم که نهایت تلاش خود را برای توقف این جنگ ظالمانه و یافتن راه‌حلی مسالمت‌آمیز و عادلانه برای پرونده هسته‌ای ایران بر اساس قوانین بین‌المللی به کار گیرند.
٢٢ /ذی الحجه/ ١٤٤٦هـ
دفتر آیت‌الله سیستانی (مدّ ظلّه) – نجف اشرف

بیانیه آیت‌الله شبیری ‌زنجانی 
در محکومیت تهدید رهبر معظم انقلاب
آیت‌الله شبیری زنجانی نیز با صدور بیانیه‌ای جنایات رژیم صهیونیستی و تهدید رهبر معظم انقلاب توسط این رژیم را محکوم کرد.
به گزارش خبرگزاری حوزه، متن بیانیه دفتر آیت‌الله شبیری زنجانی بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
قال الله تبارک و تعالی: إِنَّ اللَّهَ یُدَافِعُ عَنِ الَّذِینَ آمَنُوا إِنَّ اللَّهَ لَا یُحِبُّ کُلَّ خَوَّانٍ کَفُورٍ. أُذِنَ لِلَّذِینَ یُقَاتَلُونَ بِأَنَّهُمْ ظُلِمُوا وَإِنَّ اللَّهَ عَلَی نَصْرِهِمْ لَقَدِیرٌ (حج / ۳۸ و ۳۹)
در ادامه تجاوز رژیم سفّاک به سرزمین اسلامی، این رژیم با نقض آشکار حقوق اولیه انسانی، به کشتار زنان، کودکان، بی‌گناهان و نظامیان و غیرنظامیان پرداخته و به طور آشکار مقام معظّم رهبری (دامت برکاته) را تهدید کرده است.
ضمن محکومیت شدید این اقدامات، تأکید می‌شود که در این شرایط حسّاس، حفظ وحدت ملی، هوشیاری، خیرخواهی، انسجام مؤمنین و مواسات با یکدیگر، سلاحی سترگ در برابر این تهدیدات است و بر همه صاحبان قلم و نهادهای بین‌المللی است که با اقدامات قاطع، مانع این تجاوز ظالمانه و خسارت جبران‌ناپذیر شوند.
در آستانه ایام عزای حضرت اباعبدالله الحسین علیه‌السلام، بر همه مؤمنین است که با حضور پرشکوه و پرمعنای خود در مجالس توسل آل‌الله، رحمت الهی را برای دیار محبان و وفاداران به اهل‌بیت علیهم‌السلام جلب نموده و با دعا و استغاثه به درگاه ربوبی، ظهور حضرت بقیة‌الله الأعظم (عجل‌الله فرجه الشریف) و پایان آلام بشریت را مسئلت نمایند.
دفتر حضرت آیت‌الله العظمی شبیری زنجانی 
«مدظله العالی»
آیت‌الله جوادی آملی: امید است رهبر معظم انقلاب که محور استقلال و عمود استقامت‌اند 
در پناه خدای سبحان باشند
همچنین، آیت‌الله‌ جوادی آملی در پیامی دعا کردند که ایران اسلامی، عموم مردم، دانشمندان و مسئولان نظامی و سیاستمداران عالی رتبه و رهبر معظم انقلاب در پناه خدای سبحان باشند.
متن پیام آیت‌الله جوادی آملی بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
قهر و مهر نظام هستی در اختیار آفریدگار آن است.
نظم جهان بر قهر نسبت به ظالم است.
امید است ایران اسلامی، عموم مردم، دانشمندان و مسئولان نظامی و سیاستمداران عالی‌رتبه و رهبر معظم انقلاب که محور استقلال و عمود استقامت‌اند، در پناه خدای سبحان باشند.
جوادی آملی
تاریخ: 28/3/1404
آیت‌الله مظاهری: تهدیدهای ترامپ 
سرنوشت شومی را برای آمریکا و رژیم صهیونیستی 
رقم خواهد زد
آیت‌الله مظاهری نیز در پیامی تصریح کرد: اینک رئیس‌جمهور بی‌آبروی آمریکا، از سر حماقت و رذالت و با بی‌شرمی ملّت آزاده و مقاوم ایران و نیز رهبر شجاع و قدرتمند این ملت را، تهدید به تسلیم و ترور می‌نماید! و نمی‌داند که این تهدیدهای تروریستی و خباثت‌آمیز، چه سرنوشت شومی را برای این جنایتکاران تاریخ رقم خواهد زد.
متن پیام به این شرح است:
بِسْمِ اللهِ الرَّحْمنِ الرَّحیمِ
«وَ مَکَرُوا وَ مَکَرَ اللَّهُ وَ اللَّهُ خَیْرُ الْماکِرینَ»
در ادامۀ جنایت بزرگ رژیم سفّاک صهیونیستی در تجاوز و حملۀ وحشیانه به میهن اسلامی عزیزمان که قطعاً با هماهنگی و پشتیبانی شیطان بزرگ آمریکای جنایتکار، انجام پذیرفته است، اینک رئیس‌جمهور بی‌آبروی آمریکا، از سر حماقت و رذالت و با بی‌شرمی هرچه تمام‌تر، ملّت بزرگ و مظلوم و آزاده و مقاوم ایران و نیز رهبر شجاع و قدرتمند این ملت را که حافظ کیان امّت و محور استقلال و عزّت این کشور است، تهدید به تسلیم و ترور می‌نماید! و نمی‌داند که این تهدیدهای تروریستی و خباثت‌آمیز، چه سرنوشت شومی را برای این جنایتکاران تاریخ رقم خواهد زد!
«قُلْ هَلْ تَرَبَّصُونَ بِنا إِلاَّ إِحْدَی الْحُسْنَیَیْنِ وَ نَحْنُ نَتَرَبَّصُ بِکُمْ أَنْ یُصیبَکُمُ اللَّهُ بِعَذابٍ مِنْ عِنْدِهِ أَوْ بِأَیْدینا فَتَرَبَّصُوا إِنَّا مَعَکُمْ مُتَرَبِّصُون‏َ»!
بی‌تردید، ملّت مؤمن و بصیر و مجاهد و شریف ایران اسلامی با توکّل بر خداوند جبّار و منتقم و با توسل به پیشگاه حضرات اولیای عظیم الشأن «علیهم‌السلام»، خصوصاً حضرت بقیةالله الأعظم مهدی موعود«عجل‌الله‌تعالی‌فرجه‌الشریف» که کهف حصین و غیاث مضطر مستکین است با دست قدرت و انتقام الهی بر دشمنان مجرم و ددمنش خود، فائق خواهد آمد و با لطف و یاری خداوند متعال به پیروزی و سربلندی هرچه بیشتر خواهد رسید.
«فَانْتَقَمْنا مِنَ الَّذینَ أَجْرَمُوا وَ کانَ حَقًّا عَلَیْنا نَصْرُ الْمُؤْمِنینَ»
والسلام علی جمیع عباد الله الصالحین
حسین المظاهری
٢٨/خرداد/۱۴۰۴
آیت‌الله سبحانی: اهانت به جمهوری اسلامی
 و رهبری معظم انقلاب محکوم‌ 
و نشانه درماندگی دشمن است
همچنین، آیت‌الله سبحانی در پی تهدید ترامپ به ساحت رهبر انقلاب گفتند: هر نوع اهانت به نظام ‌جمهوری اسلامی و مقام‌ رهبری محکوم‌ بوده و این نشانه عجز و درماندگی دشمن است.
متن این بیانیه بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
بسم الله قاصم الجبارین‌
در چنین شرایط حساس که بر همگان روشن و آشکار است، بر علمای اسلام و پیشوای دینی در همه نقاط جهان، وظیفه است که با بیانیه‌های متحد، این نوع تجاوز کفر به جهان اسلام را محکوم نموده و همگی با صدای واحد، خواهان توقف آن شوند. مسلما چنین اقدام از آنان مؤثر خواهد بود.
در پایان هر نوع اهانت به نظام‌جمهوری اسلامی و مقام‌ رهبری محکوم‌ بوده و این نشانه عجز و درماندگی دشمن است.
خداوندا اید الاسلام و المسلمین
قم- جعفر سبحانی
۲۹ خرداد۱۴۰۴
آیت‌الله مکارم ‌شیرازی: نیروهای مسلح باید 
با غافلگیری و ضربه به جبهۀ مقابل، کاری کنند که دشمن به خود اجازۀ این‌گونه افکار و این تهدیدها را ندهد
آیت‌الله مکارم شیرازی نیز تصریح کردند: وجود رهبری معظم انقلاب به عنوان حافظ کیان شیعه بلکه امت اسلامی نقطه‌ای حساس در عقیدۀ ماست و هیچ مسلمان صالح و آزاده‌ای این تهدید را برنمی‌تابد.
متن پیام بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
«وَقَاتِلُوهُمْ حَتَّی لَا تَکُونَ فِتْنَةٌ»
با گذشت چند روز از تجاوز و حملۀ ظالمانۀ رژیم وحشی صهیونی به کشور عزیز ایران و به خاک و خون کشیدن زنان و کودکان بی‌گناه و حمله به رسانه‌ها و زیرساخت‌ها، ملّت ایران اسلامی، همدل و یکپارچه و دلگرم به وعدۀ نصرت الهی و پشت سر رهبری خود ایستاده و استقامت می‌کند و همۀ این سختی‌ها و بیش از آن را تا ریشه‌کن‌شدن تهدید اسرائیل جنایت‌کار، تحمل می‌کند و همان‌طور که قرآن فرموده: «إِنْ تَکُونُوا تَأْلَمُونَ فَإِنَّهُمْ یَأْلَمُونَ کَمَا تَأْلَمُونَ وَتَرْجُونَ مِنَ اللَّهِ مَا لَا یَرْجُونَ» امید به یاری و عنایات الهی را از دست نمی‌دهند و منتظر تحقق وعدۀ نهائی خداوند متعال هستند.
اما این رژیم جعلی و باطل و سردمداران بیچارۀ آن در نهایت ضعف و بعد از شکّه‌شدن از دستاوردهای رزمندگان و سربازان اسلام با خیالِ تکیه به قدرت مادی و پوچ آمریکا و برخی دولت‌های اروپایی و همدستی برخی دولت‌های منطقه همگی دنبال راه فرار از وضع موجود سرزمین‌های اشغالی هستند تا جایی که از روی حماقت زبان به تهدید رهبری معظم انقلاب گشوده‌اند.
در این‌جا تذکر چند نکته لازم است:
اولاً: وجود رهبری به عنوان حافظ کیان شیعه بلکه امت اسلامی نقطه‌ای حساس در عقیدۀ ماست و هیچ مسلمان صالح و آزاده‌ای این تهدید را برنمی‌تابد؛ لذا لازم است مسلمانان و آزادگان در سراسر دنیا به هر صورت ممکن بر حمایت از ایشان و محکومیت هرگونه جسارتی تأکید کنند تا همه بدانند امت‌های جهان در مقابل آنان قرار دارند.
ثانیاً: نیروهای مسلح همان‌گونه که تاکنون با قدرت، عرصه را بر دشمن سخت کرده‌اند باید ضمن ابتکار، و با غافلگیری و ضربه به جبهۀ مقابل، کاری کنند که دشمن به خود اجازۀ این‌گونه افکار و این تهدیدها را ندهد.
ثالثاً: قطعاً آنچه دست برتر ما در همۀ جبهه‌ها بوده و خواهد بود ایمان مردم و رزمندگان ماست؛ لذا لازم است همۀ مردم و مؤمنان در این شرایط سخت، خالصانه به درگاه خداوند متعال دست نیاز برآورند و به صورت فردی و جمعی از دعا و تضرع به درگاه الهی و توسل به ساحت معصومین علیهم‌السلام کوتاهی نکنند، چراکه دشمن شما هر کسی که باشد باز هم «یَدُ اللَّهِ فَوْقَ أَیْدِیهِمْ».
والسلام علیکم و رحمة الله
قم - ناصر مکارم شیرازی
آیت‌الله نوری‌همدانی: هرگونه تعرض 
به رهبری امت اسلامی تعرض به اساس اسلام 
و جان کل مسلمانان است
آیت‌الله نوری همدانی نیز در حمایت از مقام مرجعیت و رهبری معظم انقلاب اسلامی پیامی صادر کرد که متن آن بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
رئیس‌جمهور جنایتکار آمریکا که در کارنامه سیاه خود جز قتل و غارت و آدم کشی چیز دیگری ندارد و پیوسته از جنایات رژیم سفاک صهیونیستی حمایت نموده، در یک اظهار نظر احمقانه نسبت به ساحت مقام مرجعیت و رهبری انقلاب اسلامی حضرت آیت‌الله آقای خامنه‌ای (مدّظله‌العالی) جسارت نموده است. این شخصیت بزرگ پرچم‌دار عزت اسلام و فریادرس مظلومان امت اسلامی در عصر حاضر هستند.
دشمنی سران استکبار با این وجود شریف نه از سر قدرت، بلکه از شدت درماندگی و هراس آنان از گسترش بیداری اسلامی و نفوذ گفتمان مقاومت در سراسر عالم است.
ما اعلام می‌کنیم که هرگونه تعرض به مرجع بزرگوار و رهبری امت اسلامی تعرض به اساس اسلام و به جان کل مسلمانان محسوب می‌شود و با واکنش سخت و کوبنده ملت مؤمن ایران و همه آزادگان جهان مواجه خواهد شد. آمریکا و حاکمان ستم‌پیشه آن باید بدانند که این تهدیدها نه‌تنها خللی در اراده ملت ما ایجاد نمی‌کند، بلکه موجب استحکام بیشتر صفوف امت اسلامی خواهد شد.
همگان بدانند که وعده خداوند متعال تخلف‌ناپذیر است. (وَلَیَنْصُرَنَّ اللَّهُ مَنْ یَنْصُرُهُ إِنَّ اللَّهَ لَقَوِیٌّ عَزِیزٌ)
حسین نوری همدانی
۲۸ خرداد ماه ۱۴۰۴